Sinsoma GmbH

Bulk-Sample Metabarcoding

Molekulare Bestimmung des Artenspektrums von Mischproben

DNA-Metabarcoding ermöglicht es, die Artenvielfalt von Misch- und Sammelproben zu erfassen. Dabei werden zwei Technologien miteinander kombiniert: die DNA-Sequenzierung im Hochdurchsatz (NGS, HTS) und die Artidentifikation anhand von DNA-Barcodes mittels spezieller bioinformatischer Analysen.

  1. Eine Sammelprobe (z.B. Kicknet oder Malaisefallenprobe) dient als Ausgangsmaterial.
  2. DNA aller Organismen in der Probe wird extrahiert.
  3. Ein bestimmter Genabschnitt wird mittels speziell von uns entwickelter Sonden vervielfältigt.
  4. Die DNA Sequenzen dieser Genabschnitte werden für jede Art separat gelesen, analysiert und mit Referenzdatenbanken verglichen um die Artenzusammensetzung in Ihrer Probe zu identifizieren.

Sie erhalten von uns

  • Eine Übersicht des angewandten methodischen Ansatzes.
  • Die Information über das in ihrer Probe gefundene Organismenspektrum inklusive der Anzahl der Sequenzen pro Art und ihre Bestimmungsgenauigkeit.
  • Darüber hinaus stehen Ihnen unsere SpezialistInnen sowohl während als auch nach Abschluss der Analysen beratend zur Verfügung.